Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15V9GYD0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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