Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN6Q9Y6Q1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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