Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2L3Q9Y4A8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms