Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG3Q9Y2Y8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRG3Q9Y2Y8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRG3Q9Y2Y8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG3Q9Y2Y8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms