Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms