Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD4BQ9Y2L6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMD4BQ9Y2L6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms