Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP20Q9Y2K6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms