Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms