Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms