Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC5Q9UL62 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRPC5Q9UL62 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPC5Q9UL62 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms