Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms