Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN16Q9UKR8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms