Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00527Q9UJ94 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms