Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms