Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms