Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms