Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms