Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX1-2Q9UD57 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms