Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms