Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms