Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPASTQ9UBP0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms