Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC6Q9UBN7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms