Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MBD5Q9P267 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MBD5Q9P267 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MBD5Q9P267 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms