Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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