Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCMF1Q9P0J7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms