Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF12Q9NZN5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms