Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXL2Q9NZ53 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXL2Q9NZ53 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms