Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms