Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMP3Q9NV31 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms