Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms