Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TREX1Q9NSU2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms