Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRMQ9NS64 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPRMQ9NS64 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPRMQ9NS64 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPRMQ9NS64 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPRMQ9NS64 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms