Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOPORSQ9NS56 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms