Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLBQ9NRJ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms