Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI5

NMRK2, Nicotinamide riboside kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK2Q9NPI5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NMRK2Q9NPI5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK2Q9NPI5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms