Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPCPD1Q9NPB8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPCPD1Q9NPB8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms