Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVK-5Q9HDB9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms