Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms