Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD3Q9H7E2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms