Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf49Q9H6J7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms