Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms