Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms