Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms