Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA4CQ9C0C4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms