Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms