Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIFKQ9BYG3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms