Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms