Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms