Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLVAPQ9BX97 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms