Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2Q9BX26 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms